<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Huong,<div><br></div><div>We will need to know a lot more about what you are trying to do before we can discern what your problem is. </div><div><br></div><div>Probably the best thing for you to do is to tell us the following:</div><div><br></div><div>What problem are you trying to run?</div><div><br></div><div>What units are you compiling in? (They are in the setup_units file)</div><div><br></div><div>What setup call did you use? (This is in the setup_call file)</div><div><br></div><div>What parameter file are you using (flash.par)? This seems especially relevant given all of the unknown parameters you have.</div><div><br></div><div>All of those files should be within the object directory.</div><div><br></div><div>Best,</div><div><br></div><div>John Z</div><div><br><div><div>On May 7, 2010, at 4:32 PM, huong luu wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite"><span class="Apple-style-span" style="font-family: arial, sans-serif; font-size: 13px; border-collapse: collapse; ">Hi,<div>I am trying to run FLASH3. In my system, I have installed HDF1.6 serial. I use the gfortran makefile and I believe that I have all the the parameters in the Makefile correctly (I also attached the Makefile here. Can you have a quick look at it?). I successfully created flash3 executable file.</div>
<div><br></div><div>However, when I run it, I have this error:</div><div><br></div><div><div>[luu1@cn77 object]$ ./flash3</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "iProcs"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "jProcs"...</div>
<div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "kProcs"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "order"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "slopeLimiter"...</div>
<div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "LimitedSlopeBeta"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "charLimiting"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "RiemannSolver"...</div>
<div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "shockInstabilityFix"...</div><div> RuntimeParameters_read:  ignoring unknown parameter "shockDetect"...</div><div> MaterialProperties initialized</div>
<div> Cosmology initialized</div><div> Source terms initialized</div><div>  iteration, no. not moved =            0           0</div><div> refined: total leaf blocks =            1</div><div> refined: total blocks =            1</div>
<div><b>Assertion failed in file ../../../../../src/mpich2-1.2.1/src/mpi/coll/helper_fns.c at line 337: 0</b></div><div><b>memcpy argument memory ranges overlap, dst_=0x18e80880 src_=0x18e80880 len_=96</b></div><div><b><br>
</b></div><div><b>internal ABORT - process 0</b></div></div><div><br></div><div>Have you ever encounter this error and do you have any idea how to fix it?</div><div><br></div><div>Thanks a lot in advance,</div><div>Huong</div>
</span>
<span><Makefile.h.gfortran></span></blockquote></div><br></div></body></html>