<div dir="ltr">Hi Chris,<div style>  Thanks, that did the trick. And it's good to know the mpich2-1.2.1 no longer allows in-place AllGather for some of my own work.</div><div style><br></div><div style>Cheers,</div><div style>
  -Mark</div></div><div class="gmail_extra"><br><br><div class="gmail_quote">On Fri, Apr 5, 2013 at 9:35 AM, Christopher Daley <span dir="ltr"><<a href="mailto:cdaley@flash.uchicago.edu" target="_blank">cdaley@flash.uchicago.edu</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div bgcolor="#FFFFFF" text="#000000">
    <div>Hi Mark, <br>
      <br>
      We fixed this issue a while back.<br>
      <br>
      You can apply the following patch<br>
      
      <a href="http://flash.uchicago.edu/%7Ecdaley/FLASH3.2_patches/fix_mpi_calls/fix_mpi_calls.diff" target="_blank">http://flash.uchicago.edu/~cdaley/FLASH3.2_patches/fix_mpi_calls/fix_mpi_calls.diff</a><br>
      <br>
      but a better solution is to update to the latest version of FLASH.<br>
      <br>
      Chris<div><div class="h5"><br>
      <br>
      On 04/05/2013 11:27 AM, Mark L Richardson wrote:<br>
    </div></div></div><div><div class="h5">
    <blockquote type="cite">
      <div dir="ltr">Hello Klaus,
        <div>  This is the same Sedov build that runs fine on
          Lonestar.</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>The line appears to be in mpi_amr_morton_limits:</div>
        <div><br>
        </div>
        <div>
          <div>
                  call MPI_Allgather(morton_limits(1,1,1,mype+1),
             6*4,MPI_INTEGER, & </div>
          <div>     &                  
            morton_limits,6*4,MPI_INTEGER, & </div>
          <div>     &                   MPI_COMM_WORLD,ierror)</div>
          <div><br>
          </div>
          <div>Thanks for your help,</div>
          <div>  -Mark</div>
          <div><br>
          </div>
        </div>
      </div>
      <div class="gmail_extra"><br>
        <br>
        <div class="gmail_quote">On Fri, Apr 5, 2013 at 7:43 AM, Klaus
          Weide <span dir="ltr"><<a href="mailto:klaus@flash.uchicago.edu" target="_blank">klaus@flash.uchicago.edu</a>></span>
          wrote:<br>
          <blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
            <div>On Fri, 5 Apr 2013, Mark L Richardson wrote:<br>
              <br>
              > [cli_0]: aborting job:<br>
              > Fatal error in PMPI_Allgather:<br>
              > Invalid buffer pointer, error stack:<br>
              > PMPI_Allgather(975): MPI_Allgather(sbuf=0xd665eb0,
              scount=24, MPI_INTEGER,<br>
              > rbuf=0xd665eb0, rcount=24, MPI_INTEGER,
              MPI_COMM_WORLD) failed<br>
              > PMPI_Allgather(950): Buffers must not be aliased<br>
              ><br>
              ><br>
              > Has anyone dealt with this before?<br>
              <br>
            </div>
            Mark,<br>
            <br>
            You seem to have somewhere in the source a call to Allgather
            that<br>
            improperly uses the same buffer as the first and 4th actual
            argument.<br>
            <br>
            Try to locate this call. I assume it is in user-provided
            code; if it<br>
            was in a part of the FLASH code that gets exercised under
            normal<br>
            circumstances, we should have already run into it and fixed
            it.<br>
            <span><font color="#888888"><br>
                Klaus<br>
              </font></span></blockquote>
        </div>
        <br>
        <br clear="all">
        <div><br>
        </div>
        -- <br>
        Mark Richardson, <br>
        <a href="mailto:Mark.L.Richardson@asu.edu" target="_blank">Mark.L.Richardson@asu.edu</a>
        <div>Ph.D. Candidate: Astrophysics<br>
          ISTB4 623<br>
          School of Earth and Space Exploration<br>
          Arizona State University<br>
          <a href="tel:480%20318-4449" value="+14803184449" target="_blank">480 318-4449</a><br>
          <a href="http://www.public.asu.edu/%7Emlricha4" target="_blank">www.public.asu.edu/~mlricha4</a><br>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
  </div></div></div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br>Mark Richardson, <br><a href="mailto:Mark.L.Richardson@asu.edu" target="_blank">Mark.L.Richardson@asu.edu</a><div>Ph.D. Candidate: Astrophysics<br>ISTB4 623<br>
School of Earth and Space Exploration<br>Arizona State University<br>480 318-4449<br><a href="http://www.public.asu.edu/~mlricha4" target="_blank">www.public.asu.edu/~mlricha4</a><br></div>
</div>