<html><head><meta http-equiv="Content-Type" content="text/html charset=utf-8"></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">Hi James,<div class=""><br class=""></div><div class="">I tried a 3D Sedov with the same setup line (minus the +parallelIO) in 4.2.2 and I didn’t get a segfault.  The transOrder option is obsolete and should always be =1 in the code.  The fact that it even appears in the code anymore is vestigial.  I would suggest removing it from your Config file, then resetup without the -noclobber option.  It can sometimes cause strange behavior.</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Sean</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><br class=""><div class="">
<div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class=""><div style="color: rgb(0, 0, 0); letter-spacing: normal; orphans: auto; text-align: start; text-indent: 0px; text-transform: none; white-space: normal; widows: auto; word-spacing: 0px; -webkit-text-stroke-width: 0px; word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space;" class="">-----------------------------------------------------------<br class="">Sean M. Couch<br class="">Theoretical Astrophysics Including Relativity<br class="">California Institute of Technology<br class="">Mail Code 350-17<br class="">Pasadena, CA  91125<br class="">(626) 395-4282<br class=""><a href="http://www.tapir.caltech.edu/~smc" class="">www.tapir.caltech.edu/~smc</a></div></div></div>
</div>
<br class=""><div><blockquote type="cite" class=""><div class="">On Dec 18, 2014, at 3:43 PM, James Guillochon <<a href="mailto:jfg@ucolick.org" class="">jfg@ucolick.org</a>> wrote:</div><br class="Apple-interchange-newline"><div class=""><div dir="ltr" class="">Hi all, I'm experiencing a segmentation fault at line 117 in hy_uhd_upwindTransverseFlux.F90 in FLASH 4.2.2 when taking the very first hydro step. It appears that the transverse flux array is not defined for some reason. I've also noticed, oddly, that the "transOrder" option does not appear with the +uhd flag, but only when I include the unit in my Config file, however, adding this unit does not solve the seg fault. When I switch to the unoptimized solver (+uhdold), the code *does* work. Here is my setup line:<div class=""><br class=""></div><div class="">./setup MultiTidal -noclobber -maxblocks=500 -nxb=8 -nyb=8 -nzb=8 -auto -3d -objdir=object_multitidal +newMpole +parallelIO +pm4dev +uhd</div><div class=""><br class=""></div><div class="">Included units:</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><div class="">REQUIRES Driver</div><div class="">REQUIRES Simulation/SimulationComposition</div><div class="">REQUIRES Multispecies/MultispeciesMain</div><div class="">REQUIRES physics/sourceTerms/Cool/CoolMain</div><div class="">REQUIRES IO</div><div class="">REQUIRES IO/IOMain/hdf5/parallel/PM</div><div class=""><br class=""></div><div class="">And modified core files:</div><div class=""><br class=""></div><div class=""><div class="">Simulation_initSpecies.F90</div><div class="">gr_sanitizeDataAfterInterp.F90</div><div class="">Simulation_sendOutputData.F90</div><div class="">gr_markVarThreshold.F90</div><div class="">Gravity_accelOneRow.F90</div><div class="">gr_mpoleCen3Dcartesian.F90</div><div class="">Simulation_initBlock.F90</div><div class="">Simulation_finalize.F90</div><div class="">Simulation_data.F90</div><div class="">Simulation_init.F90</div><div class="">Gravity_potentialListOfBlocks.F90</div><div class="">IO_writePlotfile.F90</div><div class="">Particles_sinkAdvanceParticles.F90</div><div class="">Driver_sourceTerms.F90</div><div class="">Grid_markRefineDerefine.F90</div><div class="">Particles_sinkAccelSinksOnGas.F90</div><div class="">pt_sinkAccelSinksOnSinks.F90</div></div><div class=""><br class=""></div><div class="">Any help would be much appreciated!</div><div class="gmail_signature"></div>
</div></div>
</div></blockquote></div><br class=""></div></body></html>