<div dir="ltr"><div><div>Hi Youngjun,<br><br></div>I have seen this error with gcc 4.9.1 when filling guard cells. The two options you have for this is to either degrade to an older version (4.7 should be ok), or compile without optimization the mpi_amr_1blk_guardcell. Add the following lines in the end of your makefile: <br><br>#----------------------------------------------------------------------------<br># Fake existence of iso_c_bindings module to prevent unnecessary recompilations.<br>#---------------------------------------------------------------------------- <br>ifeq ($(FLASHBINARY),true)<br>iso_c_binding.mod :<br>        touch $@<br>#gcc version 4.9.1 results in MPI communication errors <br>#unless we compile with -O0<br>mpi_amr_1blk_guardcell.o : %.o : %.F90<br>        $(FCOMP) $(FFLAGS) -O0 $(F90FLAGS) $(FDEFINES)  $<<br>endif<br><br><br></div>Please let us know if this works for you. We will try to come up with a more elegant solution in the upcoming releases.   <br><div><br></div><div>Best,<br></div><div>-- Petros<br></div><div><br></div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Feb 10, 2015 at 8:24 AM, Youngjun LEE <span dir="ltr"><<a href="mailto:m13lu2@gmail.com" target="_blank">m13lu2@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div>Hello everyone,<br><br></div>I'm having trouble running the FLASH code with mpich. This error only occurs within mpirun command. The error message is:<br><br><br>Paramesh error : pe            1  needed full blk            1           0  but could not find it or only  found part of it in the message buffer.  Contact PARAMESH developers for help.<br><br><br><br></div>Does anyone knows how to solve this issue?<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><br><div><div><br><br clear="all"><div><div><div><div><div><div><br>-- <br><div><div dir="ltr"><div style="text-align:right"><div><div><div><font><i>LEE Youngjun<br></i></font></div><font><i>Plasma Theory and Nonlinear Dynamics Lab.<br></i></font></div><font><i>Department of Physics<br></i></font></div><font><i>Chung-Ang University, Seoul, Korea<br></i></font></div><div style="text-align:right"><font><i>Mobile: <a href="tel:%2B82-10-3230-9213" value="+821032309213" target="_blank">+82-10-3230-9213</a></i></font><br></div></div></div>
</div></div></div></div></div></div></div></div></font></span></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><br>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr">/* ************************************************* *<br>     Petros Tzeferacos, PhD                <br>                                             <br>      Research Scientist, <br>     Associate Director & Code Group Leader,<br>     Flash Center for Computational Science, <br>     Department of Astronomy & Astrophysics,<br>     University of Chicago.                    <br>     5747 S. Ellis Ave, Jones Lab. room 317<br>     Chicago, IL 60637                         <br>     Tel. 773-834-3236                         <br>     <a href="mailto:petros.tzeferacos@flash.uchicago.edu" target="_blank">petros.tzeferacos@flash.uchicago.edu</a>   <br> * ************************************************* */<br></div></div>
</div>