<div dir="ltr"><div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Yes, that's exactly what I said.  How does one get FLASH to use zbar?  I just tried again after running setup with the added argument</div><div class="gmail_default" style="">-with-unit=physics/Eos/EosMain/Gamma<br></div><div class="gmail_default" style="">but I still get that d*T/P * kboltz/amu_cgs = 1.28 (= abar) instead of 0.612 (= abar/(1 + zbar)) like I would expect.</div><div class="gmail_default" style=""><br></div><div class="gmail_default" style="">Jon</div></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Sep 16, 2015 at 10:23 AM, Tomasz Plewa <span dir="ltr"><<a href="mailto:tplewa@fsu.edu" target="_blank">tplewa@fsu.edu</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">
  
    
  
  <div text="#000000" bgcolor="#FFFFFF">
    Hi Jon -<br>
    <br>
    It is frequently assumed electron pressure is negligible compared to
    ions, which is true for a nonionized gas. Obviously, the correct
    formula should take into account contributions from both ions and
    electrons. For a fully ionized gas, <br>
    <br>
    \mu = \frac{\sum_j n_j A_j }{\sum_j n_j ( 1 + Z_j) }<br>
    <br>
    Tomek<br>
    --<div><div class="h5"><br>
    <div>On 09/16/15 10:00, Jonathan Slavin
      wrote:<br>
    </div>
    <blockquote type="cite">
      
      <div dir="ltr">
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Hi all,</div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">I'm doing
          simulations aimed at understanding aspects of supernova
          remnant evolution.  Since the SNR is expanding the general
          interstellar medium, the proper mean mass per atom (i.e.
          neutrals and ions) is about 1.28 amu, given 90% H and 10% He
          by number.  As I understand it, this is set by the runtime
          parameter eos_singleSpeciesA, which corresponds to abar.  If I
          want to assume constant, uniform, complete ionization then, as
          I understand it, I need to set zbar via the runtime parameter
          eos_singleSpeciesZ, to a value of ~1.091 = 1.2/1.1 = (n(H+) +
          2*n(He++))/(n(H) + n(He)).  At least that's what I thought
          from the docs where at one point it's stated that n(e) =
          zbar*n(ion).  However, when I look at
          density*temperature/pressure*kB/amu, I get abar.  So it seems
          that zbar is not used.  What I expect is that</div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">P = (1 +
          zbar)/abar*kB*density*temperature</div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Where P is the
          total pressure (electron pressure + atom pressure).  Is this
          not true?  Do I need to specify some extra unit for zbar to be
          used (maybe -with-unit=physics/Eos/EosMain/Gamma)?  Am I
          misunderstanding the meaning of zbar?  Any help would be
          appreciated.</div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif"><br>
        </div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Thanks,</div>
        <div class="gmail_default" style="font-family:arial,helvetica,sans-serif">Jon</div>
        <div><br>
        </div>
        -- <br>
        <div>
          <div dir="ltr">
            <div>
              <div dir="ltr">________________________________________________________<br>
                Jonathan D. Slavin                 Harvard-Smithsonian
                CfA<br>
                <a href="mailto:jslavin@cfa.harvard.edu" target="_blank">jslavin@cfa.harvard.edu</a>   
                   60 Garden Street, MS 83<br>
                phone: <a href="tel:%28617%29%20496-7981" value="+16174967981" target="_blank">(617) 496-7981</a>       Cambridge, MA 02138-1516<br>
                cell: <a href="tel:%28781%29%20363-0035" value="+17813630035" target="_blank">(781) 363-0035</a>             USA<br>
                ________________________________________________________<br>
                <br>
              </div>
            </div>
          </div>
        </div>
      </div>
    </blockquote>
    <br>
  </div></div></div>

</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div>-- <br><div class="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">________________________________________________________<br>Jonathan D. Slavin                 Harvard-Smithsonian CfA<br><a href="mailto:jslavin@cfa.harvard.edu" target="_blank">jslavin@cfa.harvard.edu</a>       60 Garden Street, MS 83<br>phone: (617) 496-7981       Cambridge, MA 02138-1516<br>cell: (781) 363-0035             USA<br>________________________________________________________<br><br></div></div></div></div>
</div>