<div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Dear Dominik,<br><br></div>Thank you very much for the help. Without your help I would be in deep waters. <br><br></div>A small change in the Makefile.h (ubuntu 16.04) is needed to run FLASH4.3 in my<br></div>machine.<br><br></div>Thank you for your help.<br><br></div>Regards,<br><br></div>Ritam Mallick<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Wed, Jul 20, 2016 at 2:34 PM, Dominik Derigs <span dir="ltr"><<a href="mailto:derigs@ph1.uni-koeln.de" target="_blank">derigs@ph1.uni-koeln.de</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr">Hey Ritam,<div><br></div><div>Note that with Ubuntu it is *not* needed to install/compile any library! Everything can be covered by libraries that are available through the usual Ubuntu package management system.<br></div><div>I described a procedure some while ago that enables you to install FLASH in less than five minutes on any Ubuntu machine (also applies to Linux Mint and others). You just have to do four easy steps:</div><div><ol><li>Download/extract latest version of FLASH</li><li>Use the command provided below to install MPI and HDF5</li><li>Use one of the provided Makefile.h (see attachment)</li><li>Setup, compile and run FLASH.</li></ol></div><div>I will forward you the commands that I used for installing FLASH on Ubuntu 14.04 and 16.04 so 15.04 might need a mixture:<br></div><div><br></div><div>Ubuntu 14.04</div><div><div>sudo apt-get install mpich2 libmpich-dev libhdf5-7 libhdf5-dev</div></div><div><br></div><div>Ubuntu 16.04</div><div><div>sudo apt-get install mpich libmpich-dev libhdf5-dev libhdf5-mpich-dev</div></div><div><br></div><div>Note that by these commands, also mpich will be installed. Also note that the Makefiles are tuned such that they worked for me. It might be that you have to modify something, but I think it is unlikely.</div><div><br></div><div>Maybe we should add this to some official place like the FLASH manual?</div><div><br></div><div>Best regards,</div><div>Dominik</div><div class="gmail_extra"><div><div class="h5"><br><div class="gmail_quote">2016-07-20 10:00 GMT+02:00 Ritam Mallick <span dir="ltr"><<a href="mailto:mallick@iiserb.ac.in" target="_blank">mallick@iiserb.ac.in</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div><div><div><div><div><div>Dear Convenor,<br><br></div>I am an new member in the FLASH community. I am trying to compile FLASH4.3. However I cannot do that and it is showing some error. I am using ubuntu 15.04 platform. The error is shown during the running of make. There is no error if I choose +noio option. However, then I do not get any output. The problem is maybe linked to the linking of HDF5 files. However I cannot debug the error.<br></div>I am using the particular Makefile (attatched). The error message is as follows ..<br><br><font size="2">/usr/bin/mpif90 -ggdb -c -O2 -fdefault-real-8 -fdefault-double-8 -Wuninitialized  -DMAXBLOCKS=1000 -DNXB=8 -DNYB=8 -DNZB=1 -DN_DIM=2 Hydro_recalibrateEints.F90<br>/usr/bin/mpif90 -ggdb -c -O2 -fdefault-real-8 -fdefault-double-8 -Wuninitialized  -DMAXBLOCKS=1000 -DNXB=8 -DNYB=8 -DNZB=1 -DN_DIM=2 gr_xyzToBlock.F90<br>/usr/bin/mpicc -I/usr/home/ritam/hdf5-1.8.4-patch1/hdf5/include -ggdb -c -O2 -Wuninitialized -D_FORTIFY_SOURCE=2 -DMAXBLOCKS=1000 -DNXB=8 -DNYB=8 -DNZB=1 -DN_DIM=2 io_attribute.c<br>In file included from io_h5_attribute.h:7:0,<br>                 from io_attribute.h:13,<br>                 from io_attribute.c:1:<br>io_h5_type.h:7:18: fatal error: hdf5.h: No such file or directory<br> #include <hdf5.h><br>                  ^<br>compilation terminated.<br>Makefile:123: recipe for target 'io_attribute.o' failed<br>make: *** [io_attribute.o] Error 1</font><br><br><br></div>Hope you can help me in this regard.<br></div><br><br></div>Best Regards,<br><br></div>Ritam Mallick<br></div>
</blockquote></div><br><br clear="all"><div><br></div></div></div>-- <br><div data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr">Dominik Derigs<br>I. Physikalisches Institut<br>Universität zu Köln<br>Zülpicher Straße 77<br>50937 Köln<br>GERMANY</div><div dir="ltr"><br></div><div dir="ltr"><a href="https://hera.ph1.uni-koeln.de/~derigs/" target="_blank">https://hera.ph1.uni-koeln.de/~derigs/</a><br><br>Tel. (+49|0) 221 470-8352<br>Fax. (+49|0) 221 470-5162<br><br>Diese Email ist vertraulich und nur für den angegebenen Empfänger bestimmt. Zugang, Freigabe, die Kopie, die Verteilung oder Weiterleitung durch jemand anderen außer dem Empfänger selbst ist verboten und kann eine kriminelle Handlung sein. Bitte löschen Sie die Email, wenn Sie sie durch einen Fehler erhalten haben und informieren Sie den Absender.<br><br>This email and any files transmitted with it may contain confidential and/or privileged material and is intended only for the person or entity to which it is addressed. Any review, retransmission, dissemination or other use of, or taking of any action in reliance upon, this information by persons or entities other than the intended recipient is prohibited. If you have received this email in error, please notify the sender immediately and delete this material from all known records.</div></div></div></div></div></div></div></div>
</div></div>
</blockquote></div><br></div>