<div dir="ltr"><div><div>Hi Yubo,<br><br></div>Can you also send your script for your job submission? E.g. a PBS script, something you type into the terminal, etc.<br><br></div>Scott<br></div><div class="gmail_extra"><br clear="all"><div><div class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><br>Scott Feister, Ph.D.<br>Postdoctoral Researcher, Flash Center for Computational Science<br></div><div>University of Chicago, Department of Astronomy and Astrophysics<br></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>
<br><div class="gmail_quote">On Tue, Oct 4, 2016 at 9:41 AM, Yubo Qin <span dir="ltr"><<a href="mailto:qybo123@gmail.com" target="_blank">qybo123@gmail.com</a>></span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">Hi All,<br>
<br>
I am trying to run FLASH code on relative large scale, i.e., 512 cores. But did not find an appropriate input configuration.<br>
I pick up a Cellular simulation problem from the built-in FLASH test suit (~PATHTOFLASH/flash/source/<wbr>Simulation/SimulationMain/<wbr>Cellular)and was running it from 4 cores to 256 cores, as shown in attached figure, and found out that this test input configuration might suitable for running on around 64 cores, however, I want to run it on more around 512 cores. Thought I know change AMR refinement level may help, but its execution time will goes to extremely high. Also, I guess merely change AMR refinement level is not enough.<br>
<br>
Any idea of how to appropriate configure this input parameter to make this simulation problem suitable for running on large scale cluster?<br>
<br>
I attached my current input configuration file (flash.par) as well.<br><br>
<br>
Many thanks in advance!<br>
<br>
Regards,<br>
Yubo<br></blockquote></div><br></div>