<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml">
<head>
<title></title>
</head>
<body>
<div name="messageBodySection" style="font-size: 14px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, sans-serif;">Hi all,
<div><br /></div>
<div>I’m using the Ionize unit in a 2D Sedov simulation with FLASH4.3. From the log file, <b>the variable â€œh   â€œ is fully ionized</b> with â€œpositive" number of 1 and â€œnegative” 0. In the ionizing file â€œnei.F90” (line 86--87) under â€œsource/physics/sourceTerms/Ionize/IonizeMain/Nei”, hydrogen and electron mass fraction remain unchanged. But the phase plot shows that they are changing with temperature (or density):</div>
<div><img src="cid:B16E108415694157BC52D4D76EDD737C" data-originalsrc="file:///Users/gaoyuan/Documents/academic/FLASH/mmsnr_sedov_redo/scattered_h.png" /><br /></div>
<div>I have tested that other element (Oxygen) changes little with temperature, and doesn’t have a consistence with â€œh   â€œ or â€œelec”.</div>
<div><br /></div>
<div>I think there are two possibilities:</div>
<div>1. â€œh   â€œ and â€œelec” are <b>not normalised</b> after a MHD process (advection)</div>
<div>2. â€œh   â€œ is <b>not fully ionized</b>  hydrogen </div>
<div><br /></div>
<div>Do you know where is the problem with the mass fraction?</div>
<div><br /></div>
<div><br /></div>
<div>Another relating question is that in log file,  the â€œtotal” number (atomic mass) for â€œh   " is 0.904 which is strange to me. And in â€œSimulation_initSpecies.F90” under "source/Simulation/SimulationComposition/Ionize/“, the â€œh   â€œ atomic mass is set to â€œave_hmass” that changes if not all the elements are selected. They are different with each other, but seems to be stored both in â€œms_Array”. Do you know what’s the meaning for the â€œave_hmass” and which value is used in the simulation?</div>
<div><br /></div>
<div>Thanks,</div>
<div>Gao-Yuan</div>
</div>
<div name="messageSignatureSection" style="font-size: 14px; font-family: -apple-system, BlinkMacSystemFont, sans-serif;"><br />
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Gao-Yuan ZHANG</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">B-306A, 60 Garden St., Cambridge, MA 02138</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Tel: +1 617-460-2489; Skype: zgy0106</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Email: zgy0106@gmail.com</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<span style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;">Email: gao-yuan.zhang@cfa.harvard.edu</span><br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" />
<br style="font-family: Helvetica; font-size: 12px;" /></div>
</body>
</html>