I don't know much about it, but it seems that the system dynamic library loader does not know where libhdf5.so is.<br>(The compiler and the linker knows, but not the loader.)<br><br>That's not an error about FLASH. It's just one of the typical dynamic-library-missing errors:<br>error while loading shared libraries: lib***.so.***: cannot open shared object file: No such file or directory<br><br>I suggest you google linux command ldd, or linker option -R / -rpath, or environment variable LD_LIBRARY_PATH.<br>Hope that could help.<p>2019-04-03 17:45:32<a href="mailto:">"张含天" <saphirezhang@gmail.com></a>写道：</p><blockquote name="replyContent" style="padding-left: 1ex;margin: 0 0 0 0.8ex;border-left: 1px solid #ccc;"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr">Dear all,<div><br></div><div>I am new to FLASH and I want to try the first model Sedov explosion problem. But I am getting the following error.</div><div><br></div><div>My test environment is, attached is my Makefile.h</div><div>ubuntu 18.04<br></div><div>FLASH 4.6</div><div>gcc; gfortran 7.3.0</div><div>MPICH 3.3a2</div><div>hdf5 1.8.16 & 1.10.5 (tested separately)</div><div><br></div><div>Everything works well if I setup FLASH without IO, followed the manual.</div><div><span class="gmail-fontstyle0" style="font-family:CMTT10;font-size:10pt;color:rgb(0,0,0)">$ ./setup Sedov -auto +noio</span> </div><div>$  cd object/<br style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto"></div><div>$ sudo make</div><div>$ sudo mpirun -np -1 ./flash4<br></div><div>And the calculation can start. The result is attached result_noIO.</div><div><br></div><div>However, when I try the following,</div><div><div><span class="gmail-fontstyle0" style="font-family:CMTT10;font-size:10pt;color:rgb(0,0,0)">$ ./setup Sedov -auto</span></div><div>$  cd object/<br style="font-variant-numeric:normal;font-variant-east-asian:normal;line-height:normal;text-align:-webkit-auto"></div><div>$ sudo make</div><div>After '$ make', the Linking in Units and Libraries is SUCCESS. And I can find the 'flash4' file in the object/.<br></div></div><div>Then when I try '$ <span class="gmail-gr_ gmail-gr_499 gmail-gr-alert gmail-gr_spell gmail-gr_inline_cards gmail-gr_run_anim gmail-ContextualSpelling" id="gmail-499" style="color:inherit;font-size:inherit;display:inline;border-bottom:2px solid transparent;background-repeat:no-repeat">sudo</span> <span class="gmail-gr_ gmail-gr_500 gmail-gr-alert gmail-gr_spell gmail-gr_inline_cards gmail-gr_run_anim gmail-ContextualSpelling" id="gmail-500" style="color:inherit;font-size:inherit;display:inline;border-bottom:2px solid transparent;background-repeat:no-repeat">mpirun</span> -np -1 ./flash4', it returns an error (attached result_IO).</div><div><b>  ./flash4: error while loading shared libraries: libhdf5.so.10: cannot open shared object file: No such file or directory</b><br></div><div>However, the file 'libhdf5.so.10' can be found in the path '/usr/local/hdf5/lib', as written  in Makefile.h.</div><div><br></div><div>I know that there should be something wrong with the HDF5. But I can run the examples of HDF5 (under hdf5/share/hdf5_examples/c). And I tried different versions, the results were the same.</div><div><br></div><div>Can anyone give me some suggestions about this problem?</div><div><br></div><div>Kind regrads</div><div><br></div><div><p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Hantian Zhang</span></p><p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Research group PLASMANT</span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif"><span lang="EN-US" style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Department of Chemistry, University of Antwerp</span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">Campus Drie Eiken, Universiteitsplein 1</span></p>

<p class="MsoNormal" style="margin:0cm 0cm 0.0001pt;font-size:12pt;font-family:"Times New Roman",serif"><span style="font-size:11pt;font-family:Calibri,sans-serif;color:rgb(31,73,125)">BE-2610 Wilrijk-Antwerp, Belgium</span></p></div><div><br></div><div><br></div></div></div></div></div>
</div></blockquote>