<div dir="ltr">HI Nitish,<div><br></div><div>The covering grid in YT can convert dataset from AMR to a fixed resolution array.</div><div><a href="https://yt-project.org/doc/examining/low_level_inspection.html#examining-grid-data-in-a-fixed-resolution-array">https://yt-project.org/doc/examining/low_level_inspection.html#examining-grid-data-in-a-fixed-resolution-array</a></div><div><br></div><div>Best,</div><div>Yingchao</div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Mon, Sep 2, 2019 at 5:05 PM Acharya, Nitish <<a href="mailto:nachary2@ur.rochester.edu">nachary2@ur.rochester.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Hello flash users,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I'd like to do a bit of post processing of FLASH HDF5 output using Python. It's a 2D cylindrical LaserSlab Simulation data. I've managed to read the HDF5 file and it's datasets in Python and am trying to do the mesh reconstruction. </div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
1) It seems like I can retrieve the data of variables at each cell centers but HDF5 seems to provide only the coordinates of the block centers and not the cells centers. </div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
2) I'm using AMR Grid with Paramesh. If problem 1 is solved, what could be the best approach to smoothly interpolate the data from such non-uniform grids to an equally spaced uniform 2D grid generated in Python (I guess I wont be able to use a bilinear interpolation
 unless it's an uniform grid in FLASH)?</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Thanks,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Nitish</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div id="gmail-m_-3700770285118712426Signature">
<div id="gmail-m_-3700770285118712426divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">---------------------------</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">Nitish Acharya</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">PhD Student</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">Department of Mechanical Engineering</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">University of Rochester</span></p>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div>