<div dir="ltr"><div dir="ltr"><br></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Tue, Feb 11, 2020 at 2:35 PM Acharya, Nitish <<a href="mailto:nachary2@ur.rochester.edu">nachary2@ur.rochester.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">




<div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Dear flash-users,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I am trying to implement multiTemp/Gamma EOS to one of the materials in the LaserSlab and just use the tabulated EOS for the rest. There was no error during code compilation. However, I tried to modify couple lines from the following EOS routines:</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
i) eos_idealGamma.F90</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
ii) eos_idealGamma3T.F90</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
These routines were located in .../Eos/EosMain/MultiTemp/Gamma/Ye</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I modified the expression for pressure and comibinedGamc calculation. However, I dont see any changes while I plot the gamc and pres variable in VISIT.</div></div></blockquote><div><br></div><div><br></div><div>Are you modifying these files in the <i>source/physics/blah/blah </i>(from here on I'll refer to it just as <u>source</u>, even though the <i>Simulation</i> module is also apart of the source but that is the part users should really just mess with I suppose) code directly, or in the <i>object</i> directory in which you have made the executable? <br></div><div><br></div><div>I would recommend not touching the source so that you can always maintain a copy of what you downloaded, but always making new <i>Simulation/SimulationMain/ </i>directories. In that <i>Simulation/SimulationMain/</i> directory copy the files from the source that you want to edit. Then when you configure and make your <font face="monospace">flash4 </font><font face="arial, sans-serif">you can make sure that the files you've copied and symbolically linked to your <i>Simulation/SimulationMain/</i> directory rather than the source. From there edit your files and debug until it makes, then </font><font face="monospace">./flash4</font><font face="arial, sans-serif">, rinse and repeat until you feel as if you have debugged your simulation thoroughly and it provides results you may anticipate. </font></div><div><font face="arial, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif">I think that may alleviate a lot of problems like this because the first question that pops into my head is whether or not the <i>object</i> directory is actually seeing that file you have edited, especially if you're claiming results are unchanged. </font></div><div><font face="arial, sans-serif"><br></font></div><div><font face="arial, sans-serif">**** You can also do standard print statement wizardry to see if the code it getting to where you want it to be at execution.</font></div><div><br></div><div>**** Also are you putting whatever you've calculated into the UNK variables? e.g. <font face="monospace">U(PRES_VAR,i,j,k) = Nitish_Pressure </font><font face="arial, sans-serif">make sure you put those in #IFDEF statements so the compiler is kept in the loop (haha) with what you're trying to do.</font></div><div><br></div><div>Someone else who wrote those routines and knows when they are called etc. might be better to assist but this is just the quick take that I can put together in the 20 mins it took me to write this.</div><div><br></div><div>I would recommend the following before answering anything else:</div><div><br></div><div>0. Make sure you're following the recipe I described in the second paragraph above, where one makes sure to keep the original source and you know exactly what you are manipulating and changing. Then you can <font face="monospace">diff</font> the files you have edited with those from the source. I am just trying to encourage appropriate version control, which I know I also fail at keeping up with sometimes, but that always seems to be the crux to many of the problems I see folks having if they can't nail down a specific question.</div><div><br></div><div>1. Once you have configured and made your executable in such an <i>object</i> directory, add print statements in the routines you have edited. When you run the code do you see them in the standard out? </div><div> </div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr">
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)"><span style="font-size:12pt">1) For my case of implementation, how is pressure initialized and calculated later in the simulation? It seems I'm modifying the lines in wrong EOS routines.</span><span style="font-family:Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:small;color:rgb(34,34,34)"> </span></div></div></blockquote><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)"><span style="font-size:12pt">2) In the params file, I set gammaEle = 2.4, gammaIon = 2.4 and gammaRad = 1.33. When I plot gamc in ViSit, it shows 2.348. How is gamc initialized and calculated later in the simulation?</span></div></div></blockquote><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div dir="ltr"><div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
I have attached my Config files and .f90 files.</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Thanks so much,</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
Nitish</div>
<div style="font-family:Calibri,Arial,Helvetica,sans-serif;font-size:12pt;color:rgb(0,0,0)">
<br>
</div>
<div id="gmail-m_-3859737587760516960Signature">
<div id="gmail-m_-3859737587760516960divtagdefaultwrapper" dir="ltr" style="font-size:12pt;color:rgb(0,0,0);font-family:Calibri,Helvetica,sans-serif">
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">---------------------------</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">Nitish Acharya</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">PhD Student</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">Department of Mechanical Engineering</span></p>
<p style="margin-top:0px;margin-bottom:0px"><span style="font-size:10pt">University of Rochester</span></p>
</div>
</div>
</div>

</blockquote></div><div><br></div><div><br></div>Best,<br>Marissa<br clear="all"><div><br></div>-- <br><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><div dir="ltr"><font face="monospace" size="1" color="#000000">%---------------------------------------------%</font><div><font face="monospace" size="1" color="#000000">Marissa B. P. Adams</font></div><div><font face="monospace" size="1" color="#000000">(she/her/hers)</font></div><div><font face="monospace" size="1" color="#000000">Phd Candidate, University of Rochester</font></div><div><font face="monospace" size="1" color="#000000">NDVS, University of Chicago</font></div><div><font face="monospace" size="1" color="#000000"><b>E-mail:</b> <a href="mailto:marissa@flash.uchicago.edu" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">marissa@flash.uchicago.edu</a></font></div><div><font face="monospace" size="1" color="#000000"><b>Website:</b> <a href="http://www.pas.rochester.edu/~madams" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">https://www.pas.rochester.edu/~madams</a></font></div><div><font face="monospace" color="#000000" size="1"><b>Twitter:</b> <a href="https://twitter.com/mbpadams" style="color:rgb(17,85,204)" target="_blank">https://twitter.com/mbpadams</a></font></div><div><font color="#000000" face="monospace" size="1"><b>Current Location:</b></font></div><div><font color="#000000" face="monospace" size="1">553 ERC</font></div><div><font color="#000000" face="monospace" size="1">Flash Center for Computational Science</font></div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:monospace;font-size:x-small">5640 S. Ellis Ave, ERC 553</span></div><div><span style="color:rgb(0,0,0);font-family:monospace;font-size:x-small">Chicago, IL 60637</span></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div></div>