<div dir="ltr">Hey All,<div><br></div><div>I am writing today with regards to getting some aid in having FLASH 4.6.2's binary to compile correctly on a CentOS 7 singularity container build (recipe is attached to this email). I have attached the Makefile.h that I built, modeled off of the Makefile.h for Cartesius. </div><div><br></div><div>The container is running the following built directly from the CentOS official repos:</div><div>  - CentOS      7.0.0<br>  - HDF5        1.8.12<br>  - Hypre       2.11.2<br>  - netCDF CXX  4.2.8<br>  - netCDF C    4.3.3<br>  - netCDF F90  4.2-16<br>  - zlib        1.2.7<br>  - FLASH       4.6.2<br>  - OpenMPI3    3.1.3</div><div><br></div><div>Each individual part passes its tests just fine and all .o files compile correctly. I first run <i>./setup -auto -3d Sedov --site=singularity.centos7</i>. However, when <i>make -j </i>is run and then lands at the flash4 build, I get the following return:</div><div><br></div><div><pre class="gmail-c-mrkdwn__pre" style="box-sizing:inherit;margin-top:4px;margin-bottom:4px;padding:8px;font-size:12px;line-height:1.50001;font-variant-ligatures:none;white-space:pre-wrap;word-break:normal;border-radius:4px;color:rgb(29,28,29);font-family:Monaco,Menlo,Consolas,"Courier New",monospace">/usr/lib64/openmpi3/bin/mpifort -ggdb -o flash4 [...] -L /usr/lib64 -Wl,-rpath, /usr/lib64 -lhdf5 -lhdf5_fortran -lz -L /usr/lib64/openmpi3/lib -Wl,-rpath, /usr/lib64/openmpi3/lib -lmpi -lz</pre><pre class="gmail-c-mrkdwn__pre" style="box-sizing:inherit;margin-top:4px;margin-bottom:4px;padding:8px;font-size:12px;line-height:1.50001;font-variant-ligatures:none;white-space:pre-wrap;word-break:normal;border-radius:4px;color:rgb(29,28,29);font-family:Monaco,Menlo,Consolas,"Courier New",monospace">/usr/lib64: file not recognized: Is a directory<br>collect2: error: ld returned 1 exit status<br>make: *** [flash4] Error 1<br></pre>Any ideas here on how to best proceed?</div><div><br clear="all"><div><div dir="ltr" class="gmail_signature" data-smartmail="gmail_signature"><div dir="ltr"><div style="color:rgb(34,34,34)"><strong style="color:rgb(33,37,41);font-family:"Helvetica Neue LT W01_75 Bold",HelveticaNeueW01-55Roma,"Helvetica Neue",Helvetica,"Helvetica LT Std","Helvetica CY",Arial,"Lucida Grande",sans-serif"><span style="color:rgb(234,170,0)">/</span> Joseph Glaser, PhD</strong></div><span style="color:rgb(33,37,41);font-family:HelveticaNeueW01-55Roma,"Helvetica Neue",Helvetica,"Helvetica LT Std","Helvetica CY",Arial,"Lucida Grande",sans-serif">Scientific Computations Specialist @ NANOGrav</span><div style="color:rgb(34,34,34)"><font color="#212529" face="HelveticaNeueW01-55Roma, Helvetica Neue, Helvetica, Helvetica LT Std, Helvetica CY, Arial, Lucida Grande, sans-serif">Department of Physics & Astronomy<br></font><div><span style="color:rgb(33,37,41);font-family:HelveticaNeueW01-55Roma,"Helvetica Neue",Helvetica,"Helvetica LT Std","Helvetica CY",Arial,"Lucida Grande",sans-serif">West Virginia University</span></div></div></div></div></div></div></div>