<div dir="ltr">Dear Ryan,<br>Thanks a lot for the answer. The issue is resolved.<br> Best,<br><br>Kiya </div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, May 15, 2024 at 5:27 PM Ryan Farber <<a href="mailto:rjfarber@umich.edu">rjfarber@umich.edu</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hi Kiya,<br>
<br>
I don’t think you’ve provided quite enough information. Attaching the logfile would be helpful.<br>
<br>
Particularly, it’s unclear to me what you mean by nx=20. Do you mean you ran setup with -nxb=20? If so, you will have 20 cells (AKA zones) per block, as you wrote. Regarding your screenshot showing 400 cells total, then I guess you also have 20 blocks.<br>
<br>
You might have 20 blocks from setting nblockx=20 (in flash.par) or from refinement.<br>
<br>
In either case, in your Simulation_initBlock.F90 (or other file), the coordinator of all cells can be accessed by<br>
<br>
1. call Grid_getListOfBlocks<br>
2. Loop over the returned blocks<br>
3. In that loop call Grid_getCellCoordinates (check Grid_interface for the precise subroutine name). You can choose to get cell coordinates at cell center, right edge, or left edge.<br>
<br>
==<br>
If you want to know your cell coordinates just in post-processing using yt, I think your question would be appropriately asked on the yt slack help channel (and/or possibly their mailing list /IRC).<br>
<br>
But you should just have to do<br>
ds =yt.load(file_name)<br>
ad = ds.all_data()<br>
xcoords = ad[“x”]<br>
<br>
Hope that helps!<br>
<br>
Best,<br>
Ryan<br>
<br>
Sent from my iPhone<br>
<br>
> On May 15, 2024, at 6:54 AM, kiyarash Taghiniyarami <<a href="mailto:kiyarash.niyarami@gmail.com" target="_blank">kiyarash.niyarami@gmail.com</a>> wrote:<br>
> <br>
> <br>
> Dear Users,<br>
> <br>
> I run a problem in flash in 1D with nx=20 with paramesh4. In the output file as hdf5 I got  "blocks" and "coordinates" which shows me the block in each direction (x,y,z) and the coordinates of the mid-block. But when I run yt to show the file status I understood that every block has some cells. In this case there are 20 cells for each block. So my question is how can I get the coordinates of those cells?<br>
> Because in the coordinates it just shows the midblock coordinates but not cells.<br>
> Any help would be appreciated.<br>
> <br>
> P.S. I attached the picture with the relevant parts highlighted.<br>
> <br>
> Best,<br>
> Kiya <br>
> <Screenshot from 2024-05-15 14-17-51.png><br>
> _______________________________________________<br>
> flash-users mailing list<br>
> <a href="mailto:flash-users@flash.rochester.edu" target="_blank">flash-users@flash.rochester.edu</a><br>
> <br>
> For list info, including unsubscribe:<br>
> <a href="https://flash.rochester.edu/mailman/listinfo/flash-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://flash.rochester.edu/mailman/listinfo/flash-users</a><br>
</blockquote></div>