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<body dir="ltr">
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Dear all,</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
We are trying to install FLASH on our cluster, but we are having issues when compiling HDF5 parallel. Below the loaded modules and the error message while trying to configure HDF5:</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
[~/software/flash/hdf5-1.8.10-patch1] (33 files, 1.1M) > module list</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Currently Loaded Modulefiles:</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
  1) null                 3) toolbox/1.0          5) mpi/openmpi/1.10.7</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
  2) uppdrag/base         4) local-soft/1.0       6) mpi/intel-mpi</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
[~/software/flash/hdf5-1.8.10-patch1] (33 files, 1.1M) > CC = mpicc ./configure --prefix=/usr/local/lib/HDF5-parallel --enable-parallel</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
-bash: CC: command not found</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
[~/software/flash/hdf5-1.8.10-patch1] (33 files, 1.1M) > mpicc ./configure --prefix=/usr/local/lib/HDF5-parallel --enable-parallel</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
./configure: file not recognized: File format not recognized</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
collect2: error: ld returned 1 exit status</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
[~/software/flash/hdf5-1.8.10-patch1] (33 files, 1.1M) > cc = mpicc ./configure --prefix=/usr/local/lib/HDF5-parallel --enable-parallel</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
cc: error: =: No such file or directory</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
cc: error: mpicc: No such file or directory</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Do you have any suggestions on how to fix this?</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Best regards</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Alessandro</div>
<!DOCTYPE HTML PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.0 Transitional//EN">
<title>Email Signature</title>
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  hr { min-width:650px; }
  table, thead, tbody, tr, td {
    font-size: inherit;
    font-family: inherit;
    white-space: nowrap;
    text-align: left;
    vertical-align: top;
  }
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<hr>
<table align="left" border="0" cellpadding="3" cellspacing="0" style="min-width:650px; border-collapse: collapse; width: 100%;">
<tbody>
<tr>
<td style="width: 250px;"><strong>Alessandro Ruocco</strong>, <span style="color:#808080;">
PhD</span></td>
<td colspan="2" rowspan="3"><a href="http://fsdynamics.fi/" target="_blank"><img alt="FS Dynamics Finland Oy AB" src="https://xchange.fsdynamics.eu/images/fsd_mail_logo.png" style="width: 200px; height: 43px; margin: 0px; float: right;"></a></td>
</tr>
<tr>
<td style="width: 250px;"><span style="color:#808080;">Engineer CFD</span></td>
</tr>
<tr>
<td style="width: 250px;"> </td>
</tr>
<tr>
<td style="white-space: nowrap; width: 300px; min-width: 300px;  vertical-align: top;">
FS Dynamics Finland Oy Ab<br>
c/o Polaris Business Park, Capella<br>
Vänrikinkuja 3<br>
<br>
FI-02600 Espoo<br>
Finland </td>
<td style="white-space: nowrap; width: 95px; min-width: 95px;  vertical-align: top;">
Phone:<br>
Email:<br>
<br>
<br>
URL:<br>
Privacy policy:<br>
</td>
<td style="white-space: nowrap; min-width: 300px;  vertical-align: top;">+358 40 839 0008<br>
alessandro.ruocco@fsdynamics.fi<br>
<br>
<br>
www.fsdynamics.fi<br>
https://fsdynamics.se/privacy-policy/<br>
</td>
</tr>
</tbody>
</table>
<br clear="all">
<hr>
 <br>
</body>
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