<html>
<head>
<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=us-ascii">
<style type="text/css" style="display:none;"> P {margin-top:0;margin-bottom:0;} </style>
</head>
<body dir="ltr">
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Hi Paul,</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
You can try the following par file options if you haven't already, which helped me to get some laserslab runs working back in FLASH4.7 (adjust accordingly if you're not doing a 3T sim):</div>
<div class="elementToProof" style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_usePOSdefComputeDt = .true.</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_posdefdtfactor = 0.1</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_numPosdefVars = 3</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_posdefVar_1 = "eele"</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_posdefVar_2 = "eion"</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
dr_posdefVar_3 = "erad"</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
The dr_posdefdtfactor of 0.1 might be a bit aggressive (i.e. too small), I haven't played with it. </div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
<br>
</div>
<div style="font-family: Aptos, Aptos_EmbeddedFont, Aptos_MSFontService, Calibri, Helvetica, sans-serif; font-size: 12pt; color: rgb(0, 0, 0);">
Graeme</div>
<div id="appendonsend"></div>
<hr style="display:inline-block;width:98%" tabindex="-1">
<div id="divRplyFwdMsg" dir="ltr"><font face="Calibri, sans-serif" style="font-size:11pt" color="#000000"><b>From:</b> flash-users <flash-users-bounces@flash.rochester.edu> on behalf of Paul Campbell <Paul.Campbell@zap.energy><br>
<b>Sent:</b> Tuesday, November 5, 2024 1:37 PM<br>
<b>To:</b> flash-users@flash.rochester.edu <flash-users@flash.rochester.edu><br>
<b>Subject:</b> [FLASH-USERS] Negative Internal Energies in the 2D, AMR, Z-Pinch problem</font>
<div> </div>
</div>
<style>
<!--
@font-face
        {font-family:"Cambria Math"}
@font-face
        {font-family:Calibri}
@font-face
        {font-family:Aptos}
p.x_MsoNormal, li.x_MsoNormal, div.x_MsoNormal
        {margin:0in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Aptos",sans-serif}
p.x_MsoListParagraph, li.x_MsoListParagraph, div.x_MsoListParagraph
        {margin-top:0in;
        margin-right:0in;
        margin-bottom:0in;
        margin-left:.5in;
        font-size:11.0pt;
        font-family:"Aptos",sans-serif}
span.x_EmailStyle17
        {font-family:"Aptos",sans-serif;
        color:windowtext}
.x_MsoChpDefault
        {font-size:11.0pt}
@page WordSection1
        {margin:1.0in 1.0in 1.0in 1.0in}
div.x_WordSection1
        {}
ol
        {margin-bottom:0in}
ul
        {margin-bottom:0in}
-->
</style>
<div lang="EN-US" link="#467886" vlink="#96607D" style="word-wrap:break-word">
<div class="x_WordSection1">
<p class="x_MsoNormal">Hello,</p>
<p class="x_MsoNormal"> </p>
<p class="x_MsoNormal">I am attempting to get the 2D Z-pinch problem working with AMR but have been unable to get the sim to run without crashing .  From the logs, I appear to be running into many negative internal energy warnings.  It looks like both the electron
 and ion temperatures/energies need to be continuously corrected.  To try and address this issue, I have tried refining on density, electron, and ion temperatures but the warnings persist.  In terms of the AMR settings, I am using a 32x32 grid with 4x4 cells,
 a lrefine_max=4, and I have left the refinement cutoffs and filters unchanged from default.  My questions are:</p>
<p class="x_MsoNormal"> </p>
<ol start="1" type="1" style="margin-top:0in">
<li class="x_MsoListParagraph" style="margin-left:0in">Is this an issue with the AMR settings, would a finer grid fix this problem?</li><li class="x_MsoListParagraph" style="margin-left:0in">Should I be refining on different parameters?</li><li class="x_MsoListParagraph" style="margin-left:0in">Is this an issue with a non-AMR setting?</li></ol>
<p class="x_MsoNormal"> </p>
<p class="x_MsoNormal" style=""><span style="font-family:"Calibri",sans-serif">Paul Campbell<br>
<br>
</span></p>
<p class="x_MsoNormal"> </p>
</div>
</div>
</body>
</html>